Λίγο πριν την αλλαγή του ΚΕΕΛΠΝΟ, οι αρμόδιοι υπουργοί εξέδωσαν απόφαση με την οποία ορίζουν τους μισθούς της διοίκησης του ΚΕΕΛΠΝΟ , βάσει της οποίας ο πρόεδρος του Κέντρου λαμβάνει μηνιαίως 3.900 ευρώ, εφόσον έχει διοριστεί με καθεστώς πλήρους και αποκλειστικής απασχόλησης. Και ο αντιπρόεδρος έχει μισθό 3.200 ευρώ, εφόσον είναι και αυτός πλήρους και αποκλειστικής απασχόλησης. Σε περίπτωση που ο αντιπρόεδρος επιλέξει καθεστώς μερικής απασχόλησης, ο μισθός του διαμορφώνεται στα 2.400 ευρώ, στα οποία περιλαμβάνονται οι πάσης φύσης αποδοχές.

Η απόφαση ισχύει από τις 7 Αυγούστου 2017 και το ετήσιο κόστος της αναμένεται να ανέλθει στα 35.500 ευρώ για το προηγούμενο έτος και στα 85.200 ευρώ από φέτος. Σημειώνεται πως η θητεία του σημερινού διοικητικού συμβουλίου  λήγει στις 13 Μαρτίου 2020.

Πρόεδρος του ΚΕΕΛΠΝΟ είναι ο Θεόφιλος Ρόζενμπεργκ, χειρουργός και αναπληρωτής καθηγητής ΕΚΠΑκαι έχει διακριθεί τόσο για την επιστημονική όσο και για την εθελοντική του προσφορά. Υπήρξε συνιδρυτής και επί πολλά έτη πρόεδρος των Ελλήνων Γιατρών του Κόσμου και από το 2007 διευθύνει το Μεταπτυχιακό Πρόγραμμα Σπουδών στο ΕΚΠΑ “Διεθνής Ιατρική - Διαχείριση Κρίσεων Υγείας”. Στο ενεργητικό του έχει πλήθος αποστολών ιατρικής ανθρωπιστικής βοήθειας σε χώρες του αναπτυσσόμενου κόσμου.

Αντιπρόεδρος του ΚΕΕΛΠΝΟ είναι ο Αγάπιος (Άγης) Τερζίδης με σημαντική δράση στον χώρο των ανθρωπιστικών μη κυβερνητικών οργανώσεων. Είναι παιδίατρος, με την πιο πρόσφατη θέση του αναπληρωτής διευθυντής της Β’ Παιδιατρικής Κλινικής του Παιδιατρικού Κέντρου Αθηνών.  Έχει εξειδικευτεί σε θέματα υγείας ευπαθών ομάδων - μετακινούμενων πληθυσμών, καθώς και στην υγεία της αναπαραγωγής. Έχει συμμετάσχει σε εθνικές και διεθνείς αποστολές των Γιατρών του Κόσμου, των Γιατρών Χωρίς Σύνορα και της ΜΚΟ PRAKSIS. Είναι ιδρυτικό μέλος των Γιατρών του Κόσμου και μέλος του ΔΣ των Γιατρών Χωρίς Σύνορα.